struct
Minimap2::Mapping
- Minimap2::Mapping
- Struct
- Value
- Object
Defined in:
minimap2/types.crConstructors
Instance Method Summary
- #block_len : Int32
- #cigar : Array(Tuple(UInt32, UInt8))
- #cigar_str : String
- #cs : String | Nil
- #is_primary : Bool
- #mapq : UInt32
- #match_len : Int32
- #md : String | Nil
- #nm : Int32
- #query_end : Int32
- #query_start : Int32
- #strand : Strand
- #target_end : Int32
- #target_len : Int32
- #target_name : String
- #target_start : Int32
Constructor Detail
def self.new(query_start : Int32, query_end : Int32, strand : Strand, target_name : String, target_len : Int32, target_start : Int32, target_end : Int32, match_len : Int32, block_len : Int32, mapq : UInt32, is_primary : Bool, cigar : Array(Tuple(UInt32, UInt8)), cigar_str : String, nm : Int32, md : String | Nil, cs : String | Nil)
#